Berikut merupakan senarai Presiden GAMIS sejak penubuhannya[1]ː[3]

1. 1989-1990 : Mohd Yusof Abdullah (UM)
2. 1990-1992 : Tiada kepimpinan
3. 1992-1993 : Ust Mohd Puad Abdul Wahab
4. 1993-1994 : Dr. Mohd Zuhdi Marzuki (UM)
5. 1998-1999 : Zaharuddin Abd Rahman (UM)
6. 1999-2000 : Borhanuddin Ahmad (UIAM)
7. 2000-2001 : (Allahyarham) Kamarul Zaman Abdullah (USM)
8. 2001-2002 : Izwan Mohd Yusoff (UM)
9. 2003-2004 : Mohd Khairul Anwar Md Zuki (UM)
10. 2004-2005 : Muhammad Ramadhan Fitri Elias (UM)
11. 2005-2006 : Muhammad Hanif Baderun (UM)
12. 2006-2007 : Ahmad Tarmizi Che Din (UIAM)
13. 2007-2009 : Dzulkhairi Mohd Noor (UM)
14. 2009-2010 : Mohd Idris Mohd Yusoff (UKM)
15. 2010-2011 : Ahmad Syazwan Hassan (UM)
16. 2011-2012 : Akram Ikrami Dato' Taib Azamudden (KUIS)
17. 2012-2014 : Muhamad Azan Safar (UKM)
18. 2014-2015 : Abdul Malik Ab Razak (UIAM)
19. 2015-2016 : Mohd Imran Bin Md Ishak (USIM)
20. 2016-2017 : Muhammad Afiq bin Awang Bakar (UIAM)
21. 2017-2018 : Muhammad Shukri Alimar Shidi (USIM)
22. 2018-2019 : Muhammad Faizzuddin bin Mohd Zai (UIAM)
23. 2019-2020 : Muhammad Ikhwan Nasyriq Bin Salahin (UKM)